La FAVE est pilotée par un Président, élu pour trois ans par l’Assemblée Générale. Il fixe les grandes orientations, représente l’association et veille à son bon fonctionnement. Il peut déléguer certaines missions à d’autres membres.

Il est épaulé par un Bureau, composé de membres actifs désignés, qui participent à la définition et à la mise en œuvre de la stratégie. Le Bureau se réunit au minimum une fois par an.

L’Assemblée Générale réunit l’ensemble des membres actifs. Elle élit le Président, approuve les rapports et le budget, et vote les orientations majeures de la fédération.

Le fonctionnement de la FAVE repose sur une gouvernance participative : chaque membre actif peut voter, être représenté, et contribuer à faire évoluer les positions de la fédération.